La Région se donne pour objectif d’améliorer la connaissance des ressources en eau, de préserver les ressources d'intérêt régional, d’optimiser l'usage de ces ressources et de favoriser les économies d'eau.
Elle souhaite également promouvoir une gestion concertée à l'échelle des bassins versant et promouvoir une gestion durable de l'eau dans les choix d'aménagement du territoire.

Cette politique passe par :

• l’accompagnement technique et financier des différentes démarches de gestion concertée réalisées à l'échelle d'unités hydrographiques cohérentes (bassin versant de rivière, nappe, lagune, zone côtière) ;
• le soutien à l'émergence de structures de gestion sur les territoires orphelins et à la mise en réseau des acteurs ;
• la mise en place et l’accompagnement technique et financier de démarches favorisant la concertation entre les acteurs porteurs de l'aménagement du territoire (SCOT, agglomérations, pays, PNR) et ceux de la gestion de l'eau ;
• l’accompagnement technique et financier d'opérations pilotes visant à promouvoir des modes d'aménagement du territoire moins impactants dans le domaine de l'eau (limitation de l'imperméabilisation, du ruissellement pluvial, pratiques non polluantes, économies d'eau...) ;
• la participation aux démarches d'échanges d'expérience eau/aménagement du territoire et à l'élaboration et la diffusion des documents de référence.

La Région Languedoc-Roussillon a adopté en novembre 2006 sa Stratégie régionale pour une gestion durable de l’eau. Sa mise en œuvre opérationnelle s’appuie sur une convention de partenariat 2007-2013 signée en juillet 2007 avec l’Etat et l’Agence de l’Eau Rhône-Méditerranée-Corse.

La Région a, par ailleurs, voté en juillet 2008 un rapport définissant les modalités d’attribution de ses aides financières.
Ces aides peuvent être apportées pour chacun des trois axes de la stratégie régionale :

• promouvoir une gestion globale et concertée de l’eau, intégrée dans les choix d’aménagement du territoire ;
• garantir durablement l’accès à une ressource de qualité ;
• préserver et restaurer les milieux aquatiques et leurs fonctionnalités.

A titre d’exemple, la Région a financé en 2010, parmi d’autres opérations :

• une étude relative à la mise en place d’une stratégie pérenne pour la protection de la ressource en eau dans la commune de Bellegarde (Gard) ;
• le plan communal d’amélioration des pratiques phytosanitaires de la commune de Narbonne (Aude) ;
• l’aide à la structuration du Syndicat mixte pour la protection et la gestion des nappes souterraines de la plaine du Roussillon (P.-O.) ;
• le projet CIPAN 2010 porté par Montpellier SupAgro : ce programme de recherche vise à limiter le risque de lessivage vers les nappes phréatiques des nitrates issus des engrais azotés, notamment par la mise en place de cultures intermédiaires pièges à nitrates (CIPAN).